百日咳的病程較長，可達百天，故稱百日咳。百日咳是一種急性呼吸道傳染疾病，會自然痊愈，但不是說達到一百日就會痊愈。百日咳有較嚴重的並發癥，對免疫力低下的寶寶更是一個強勁的威脅。
寶寶在感染後，經1~2周後就出現癥狀，發病的早期患兒有流淚、流涕、咳嗽和低熱等癥狀，與普通感冒難以區別。3~4天後咳嗽日見加重，約經1~2周後咳嗽逐漸加重而進入痙咳期，此時出現典型劇烈的痙攣性咳嗽，咳出大量黏液，並由於大力吸氣而出現猶如雞鳴樣吼聲，夜間明顯，年齡愈小，病情愈重。那麼為瞭使病程加快，可以采取怎麼樣的治療措施呢？
1、一般治療
按呼吸道傳染病隔離保持室內安靜、空氣新鮮、溫度適當，註意避免誘發患兒痙咳的因素，進食營養豐富，易於消化的食物，註意補充各種維生素和鈣劑。小嬰兒痙咳嚴重時應有專人守護。發生窒息時及時吸痰或作人工呼吸和給氧，如發生腦水腫，及時進行脫水治療，防止腦疝出現。
2、抗菌治療
卡他期應用抗生素可以減輕甚至不發生痙咳，進入痙咳期後應用，則不能縮短百日咳的臨床過程，但可以縮短排菌期及預防繼發感染，可采用能與百日咳桿菌對抗的抗生素，能滲進呼吸道分泌物中達到有效濃度。
3、並發癥治療
合並支氣管炎或肺炎時給予抗生素治療，單純肺不張可采取體位引流、吸痰、肺部理療等，必要時用支氣管鏡排除局部堵塞的分泌物。
4、急救措施
驚厥時用可用特定藥物止驚，痙咳、痰液粘稠發生痰阻窒息時立即吸痰或人工輔助呼吸。
3個月的寶寶常表現為陣發性屏氣、青紫、窒息，有的甚至出現全身痙攣、意識喪失。因此，有傢長會選擇為孩子註射百日咳疫苗，避免百日咳桿菌的入侵。痙咳期後，患兒的咳嗽逐漸減輕並進入約2~4周的恢復期。