提到蒙氏教育，人們最能想起的一個詞就是“愛與自由”，這正是它所一直倡導的原則。說到自由，我們不免會聯想到一些可怕的畫面，例如孩子亂扔玩具，他們擅長把玩具扔得隨地都是，大人們總是跟在他們屁股後面不停地收拾。如果倡導自由，是不是可以允許孩子亂扔玩具呢？實際上，蒙氏教育提倡的自由更重要的是強調成人對孩子的尊重，並非無限制的自由，孩子們應該有紀律，但這種紀律應該是靈活的。
紀律必須通過自由來實現
蒙氏教育也需要有紀律，但紀律必須通過自由實現，所以這種紀律本身是靈活的，它不同於舊式教育裡那種絕對的、不容辯駁的高壓政策。孩子要成為自己的主人，並遵守一些生活規則時，他才能管住自己的行為，這樣才是蒙氏教育裡認為“守紀律”的人，他絕不是一個失去自我的人。
自由應限制在集體利益中
孩子的自由應該被限制在集體利益之內，從行為方式上，他們應該養成良好的教養。當孩子們出現沖撞或激怒他人的行為、有粗魯或不禮貌的行為時，要引導他們反思並改變，並堅持我們的原則。我們應該幫助孩子們辨別清楚好與壞。
在蒙氏教室裡，孩子們能自由走來走去，並做一些有益的、充滿智力的自覺活動，沒有粗魯的行為，就是遵守紀律的行為。
個性化的紀律幫助孩子成長
這些個性化的紀律，可以幫助孩子們學會反省自我，他們會明白有序的道理，而且他們能在一定程度上選擇自我傾向，慢慢表現出個性，他們可以自覺地自由地展示自己。